感染性疾病科是安徽中医药大学第三附属医院以治疗感染性疾病为特色，集临床、科研和教学为一体的临床科室，科室设有住院病房、专家门诊、普通门诊，实际开放床位44 张，现有国医大师1人、安徽省江淮名医1人、安徽省名中医2人、教授3人，硕士研究生导师3人，正高职称3人、副高职称1人、主治医师4人，住院医师1人。国家中医药管理局中医药防治传染病专家指导委员会委员1人，国家中医药管理局中医药防治艾滋病专家委员会委员1人，中华中医药学会肝胆病专业委员会常务委员1人，中国中西医结合学会肝病专业委员会常务委员1人，中国民族医学会主任委员1人，安徽省传染病与寄生虫专业委员会副主任委员1人，安徽省医师协会传染病分会副主任委员1人，国家中医药管理局医政司传染病重点专科写作组长1人，中国民族医药学会肝病分会副会长1人，安徽省中医药学会肝胆病专业委员会副主任委员1人，安徽省医学会感染病分会常委1人，安徽省医学会肝病分会常委1人，安徽省中西医结合学会消化病分会常委1人，安徽省抗癌协会肝癌分会常委1人，安徽省防痨协会第二届结核病临床专业委员会委员1人。